Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca5Q91ZW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Smarca5Q91ZW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Smarca5Q91ZW3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Smarca5Q91ZW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms