Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab4bQ91ZR1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab4bQ91ZR1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab4bQ91ZR1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms