Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rrp1bQ91YK2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrp1bQ91YK2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rrp1bQ91YK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rrp1bQ91YK2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rrp1bQ91YK2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms