Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rrp9Q91WM3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rrp9Q91WM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rrp9Q91WM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rrp9Q91WM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms