Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsl6Q91WC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsl6Q91WC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acsl6Q91WC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acsl6Q91WC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acsl6Q91WC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms