Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SH3RF3Q8TEJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3RF3Q8TEJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3RF3Q8TEJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SH3RF3Q8TEJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.8 ms