Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9orf43Q8TAL5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9orf43Q8TAL5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C9orf43Q8TAL5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms