Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc12Q8R344 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc12Q8R344 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc12Q8R344 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc12Q8R344 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms