Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sf3b4Q8QZY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b4Q8QZY9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sf3b4Q8QZY9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms