Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYRIPQ8NFW9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYRIPQ8NFW9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYRIPQ8NFW9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYRIPQ8NFW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYRIPQ8NFW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms