Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
COL22A1Q8NFW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
COL22A1Q8NFW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
COL22A1Q8NFW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
COL22A1Q8NFW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
COL22A1Q8NFW1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
COL22A1Q8NFW1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms