Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACVR1CQ8NER5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACVR1CQ8NER5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACVR1CQ8NER5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACVR1CQ8NER5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms