Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HJURPQ8NCD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HJURPQ8NCD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HJURPQ8NCD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms