Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AMER3Q8N944 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMER3Q8N944 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER3Q8N944 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms