Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PDCD7Q8N8D1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCD7Q8N8D1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD7Q8N8D1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD7Q8N8D1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms