Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPM1NQ8N819 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPM1NQ8N819 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPM1NQ8N819 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1NQ8N819 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms