Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
VWDEQ8N2E2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
VWDEQ8N2E2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
VWDEQ8N2E2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
VWDEQ8N2E2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
VWDEQ8N2E2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.7 ms