Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LGI3Q8N145 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LGI3Q8N145 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGI3Q8N145 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms