Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colec12Q8K4Q8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colec12Q8K4Q8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Colec12Q8K4Q8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Colec12Q8K4Q8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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