Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdh16f2Q8K3M1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rdh16f2Q8K3M1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rdh16f2Q8K3M1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rdh16f2Q8K3M1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rdh16f2Q8K3M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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