Protein–RNA interactions for Protein: Q8K304

Tmem129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem129Q8K304 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem129Q8K304 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem129Q8K304 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem129Q8K304 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms