Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gin1Q8K259 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gin1Q8K259 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gin1Q8K259 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gin1Q8K259 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gin1Q8K259 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gin1Q8K259 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms