Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arfip2Q8K221 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arfip2Q8K221 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arfip2Q8K221 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Arfip2Q8K221 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfip2Q8K221 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms