Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr1eQ8K202 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Polr1eQ8K202 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Polr1eQ8K202 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms