Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prkd3Q8K1Y2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkd3Q8K1Y2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkd3Q8K1Y2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms