Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1H1

Tdrd7, Tudor domain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd7Q8K1H1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd7Q8K1H1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd7Q8K1H1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tdrd7Q8K1H1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd7Q8K1H1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd7Q8K1H1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms