Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RPUSD2Q8IZ73 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPUSD2Q8IZ73 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RPUSD2Q8IZ73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPUSD2Q8IZ73 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms