Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC170Q8IYT3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC170Q8IYT3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC170Q8IYT3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC170Q8IYT3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC170Q8IYT3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC170Q8IYT3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC170Q8IYT3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms