Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMNTD2Q8IXW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMNTD2Q8IXW0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMNTD2Q8IXW0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMNTD2Q8IXW0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1005.6 ms