Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK2

GALNT12, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12Q8IXK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALNT12Q8IXK2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALNT12Q8IXK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GALNT12Q8IXK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT12Q8IXK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms