Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC83Q8IWF9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC83Q8IWF9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC83Q8IWF9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms