Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
P3H3Q8IVL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC39.8■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
P3H3Q8IVL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
P3H3Q8IVL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
P3H3Q8IVL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
P3H3Q8IVL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms