Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNGA4Q8IV77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNGA4Q8IV77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNGA4Q8IV77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNGA4Q8IV77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CNGA4Q8IV77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms