Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR6

CREBRF, CREB3 regulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBRFQ8IUR6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CREBRFQ8IUR6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CREBRFQ8IUR6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CREBRFQ8IUR6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CREBRFQ8IUR6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CREBRFQ8IUR6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1189.8 ms