Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip10Q8CJ53 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip10Q8CJ53 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip10Q8CJ53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip10Q8CJ53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms