Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mterf1aQ8CHZ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mterf1aQ8CHZ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mterf1aQ8CHZ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mterf1aQ8CHZ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms