Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ercc8Q8CFD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ercc8Q8CFD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ercc8Q8CFD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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