Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ufl1Q8CCJ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ufl1Q8CCJ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ufl1Q8CCJ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ufl1Q8CCJ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ufl1Q8CCJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms