Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynpoQ8CC35 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SynpoQ8CC35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SynpoQ8CC35 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SynpoQ8CC35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms