Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc159Q8C963 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc159Q8C963 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc159Q8C963 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc159Q8C963 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms