Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Iffo1Q8BXL9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Iffo1Q8BXL9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iffo1Q8BXL9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iffo1Q8BXL9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms