Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rbbp5Q8BX09 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbbp5Q8BX09 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbbp5Q8BX09 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbbp5Q8BX09 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms