Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330017A01RikQ8BU47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330017A01RikQ8BU47 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330017A01RikQ8BU47 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330017A01RikQ8BU47 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
E330017A01RikQ8BU47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E330017A01RikQ8BU47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E330017A01RikQ8BU47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms