Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Pbrm1Q8BSQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Pbrm1Q8BSQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Pbrm1Q8BSQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms