Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SheQ8BSD5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SheQ8BSD5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SheQ8BSD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SheQ8BSD5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SheQ8BSD5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SheQ8BSD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms