Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GorabQ8BRM2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GorabQ8BRM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GorabQ8BRM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GorabQ8BRM2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms