Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtf3c4Q8BMQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms