Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sp8Q8BMJ8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sp8Q8BMJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sp8Q8BMJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sp8Q8BMJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sp8Q8BMJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms