Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gpc2Q8BKV1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpc2Q8BKV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc2Q8BKV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpc2Q8BKV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gpc2Q8BKV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc2Q8BKV1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc2Q8BKV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpc2Q8BKV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpc2Q8BKV1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms