Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frmd4aQ8BIE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frmd4aQ8BIE6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frmd4aQ8BIE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms